Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLHL13Q9P2N7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms