Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP35Q9P2H5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP35Q9P2H5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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