Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RRBP1Q9P2E9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RRBP1Q9P2E9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms