Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD5Q9P267 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MBD5Q9P267 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms