Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
COMMD8Q9NX08 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms