Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLN6Q9NWW5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms