Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMC4Q9NTJ3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMC4Q9NTJ3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms