Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKDREJQ9NTG1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms