Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRT84Q9NSB2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms