Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TM7SF3Q9NS93 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TM7SF3Q9NS93 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms