Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VPS45Q9NRW7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms