Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB6BQ9NRW1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms