Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NRIP3Q9NQ35 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NRIP3Q9NQ35 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms