Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ASCL3Q9NQ33 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms