Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PDE7BQ9NP56 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms