Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPM3Q9HCF6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPM3Q9HCF6 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPM3Q9HCF6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPM3Q9HCF6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPM3Q9HCF6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPM3Q9HCF6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPM3Q9HCF6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPM3Q9HCF6 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPM3Q9HCF6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms