Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
APOBEC3GQ9HC16 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
APOBEC3GQ9HC16 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms