Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLSPNQ9HAW4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms