Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
YTHDF1Q9BYJ9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
YTHDF1Q9BYJ9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms