Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NIFKQ9BYG3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NIFKQ9BYG3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms