Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SALL3Q9BXA9 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SALL3Q9BXA9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms