Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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