Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TREX2Q9BQ50 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TREX2Q9BQ50 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms