Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
C9orf72Q96LT7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms