Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCDC136Q96JN2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCDC136Q96JN2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms