Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRIQ1Q96JM4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
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