Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG3Q96JB2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms