Protein–RNA interactions for Protein: Q96HR3

MED30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED30Q96HR3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MED30Q96HR3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms