Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ACSBG1Q96GR2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ACSBG1Q96GR2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms