Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms