Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM3

RPUSD4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase RPUSD4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4Q96CM3 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RPUSD4Q96CM3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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