Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UTP4Q969X6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms