Protein–RNA interactions for Protein: Q92600

CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT9Q92600 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNOT9Q92600 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNOT9Q92600 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms