Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113Q902F9 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms