Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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CLDN19Q8N6F1 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CLDN19Q8N6F1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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