Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
IGSF1Q8N6C5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IGSF1Q8N6C5 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms