Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SYNE4Q8N205 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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