Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC103Q8IW40 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms