Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PRRT2Q7Z6L0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PRRT2Q7Z6L0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms