Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PTF1AQ7RTS3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PTF1AQ7RTS3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms