Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SUSD1Q6UWL2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms