Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZBED9Q6R2W3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZBED9Q6R2W3 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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