Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ANKRD54Q6NXT1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ANKRD54Q6NXT1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms