Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RWDD4Q6NW29 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RWDD4Q6NW29 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms