Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NANOGP8Q6NSW7 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NANOGP8Q6NSW7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms