Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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RTL6Q6ICC9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RTL6Q6ICC9 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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