Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ATG16L1Q676U5 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms