Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C1orf140Q5VVS0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms