Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf135Q5VTT2 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf135Q5VTT2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf135Q5VTT2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf135Q5VTT2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf135Q5VTT2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C9orf135Q5VTT2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C9orf135Q5VTT2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf135Q5VTT2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf135Q5VTT2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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