Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CEP170Q5SW79 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CEP170Q5SW79 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms